Bir kuyunun yeri, esas olarak kuyunun amacı ile belirlenir. İçme amaçlı ve sulama suyu amaçlı kuyularda yeraltı suyu kalitesi ve uzun vadeli yeraltı suyu tedariği en önemli hususlardır. Su arama ve su bulma çalışmaları yaparak kuyu yeri belirlemek için hidrojeolojik değerlendirme yapılması her zaman uzman bir kişi tarafından yapılmalıdır. İçme suyu için kullanılacak su kalitesi kriterleri, sulama suyu için ise endişe verici temel kimyasal parametreleri, tuzluluk ve sodyum adsorpsiyon oranları oldukça önemelidir. Sondaj çalışması pahalı ve maliyetli bir iştir. Bu nedenle, açılacak kuyuda karşılaşılabilecek tuz, kükürt vb maddeler yapılan masrafın ve çalışmanın boşa gitmesine neden olacaktır.
Açılacak sondajda pompalama gereksinimlerini karşılamak için yeterli yeraltı suyu mevcut olmalıdır. Belirli bir yerde bulunup bulunmadığı, yeraltı suyu miktarı ve suyun kalitesini belirlemek amacı ile yeraltı suyu danışmanlarının önceki bilgilerinden yararlanılmalıdır.
Su arama ve su bulma çalışmalarında Yerel yeraltı suyu sisteminin bulunduğu havza, yüzey topografyası, yerel bitki örtüsü, kaya özellikleri gibi bilgilerin incelenmesi yerel jeoloji, yeraltı suyu kimyası, kalınlık bilgisi, yerel akiferlerin mevcut kuyulardaki derinliği ve geçirgenliği, yeraltı suyu seviyeleri yer belirlenmesinde önemli faktörlerdir.
Bu çalışmalar deneyimli bir Jeoloji Mühendisi tarafından, arazi uydu ve hava fotoğrafları incelenerek ve jeofiziksel ölçümlerle su arama ve su bulma çalışmaları yapılarak tespit edilmelidir.
Bazı durumlarda, kuyu yeri arsanın konumu ile sınırlıdır. Pompalanan yeraltı suyunun yüzeyde taşınımı minimumda tutulmalıdır. Ayrıca sondaj ekipmanının sondaj noktasına erişimi sondaj yeri için kısıtlama oluşturmaktadır. Bir kuyunun yerini belirlerken, çevrede bulunabilecek kimyasal maddeler, potansiyel kirlilik kaynaklarının yakınlığı, depolama alanları, yakındaki akarsular, kanalizasyon hatları ve sızıntı alanları göz önünde bulundurulmalıdır.